La meleira de la papaya, también conocida como enfermedad pegajosa de la papaya, se caracteriza por la exudación espontánea de látex en frutos verdes (Figura 1). La oxidación del látex puede provocar la aparición de manchas necróticas en los frutos y darles una apariencia pegajosa. También se ha observado el desarrollo de lesiones necróticas en los ápices de las hojas jóvenes en variedades del grupo Solo en Brasil (Rodríguez et al., 2009; Perez-Brito et al., 2012). Esta enfermedad puede causar pérdidas económicas severas para los productores de papaya (Ventura et al., 2004; Perez-Brito et al., 2012). Su presencia se detectó por primera vez en Brasil a finales de la década de 1980 (Nakagawa et al., 1987) y en la actualidad se ha extendido a varios países de América Latina, incluyendo México, Ecuador, Colombia y Costa Rica (Perez-Brito et al., 2012; Quito-Avila et al., 2023), así como a Australia (Pathania et al., 2019). La meleira de la papaya es causada por complejos virales, compuestos por un virus con genoma de ARN de cadena doble, tentativamente asignado a la familia Fusagraviridae, y un virus similar a umbravirus, con genoma de ARN monocatenario de sentido positvo [ARNmc (+)], propuesto dentro de la familia Tombusviridae (Sa Antunes et al., 2016; Maurastoni et al., 2023; Quito-Avila et al., 2023). Los virus similares a umbravirus asociados a esta enfermedad incluyen el Virus de la meleira de la papaya 2 (Papaya meleira virus 2- PMeV2) en Brasil, el Virus Q de la papaya (Papaya virus Q - PpVQ) en Ecuador y el Virus de la meleira de la papaya variante mexicana (Papaya meleira virus Mexican variant - PMeV-Mx) en México (Quito-Avila et al., 2015; Zamudio-Moreno et al., 2015;

Figura 1

Sa Antunes et al., 2016). Adicionalmente, se encontró otro virus similar a umbravirus en plantas de babaco, un pariente silvestre de papaya en Ecuador, denominado Virus Q de babaco (Babaco virus Q - BabVQ) (Cornejo-Franco et al., 2021). De acuerdo a los criterios de demarcación de los umbravirus (Taliansky et al., 2003), los virus similares a umbravirus de papaya se consideran especies distintas (Cornejo-Franco et al., 2021).

Dado que los genomas de los virus similares a umbravirus (ULVs) no codifican una proteína de la cápside se han considerado como entidades subvirales denominadas ARNs similares a umbravirus (ulaRNAs) (Liu et al., 2021). Existen tres clases de ULVs en plantas, cuyos genomas varían en tamaño de 3500 a 4500 nt y contienen entre dos y cinco marcos de lectura abiertos (ORFs) (Cornejo-Franco et al., 2021; Liu et al., 2021; Redila et al., 2021; Tahir et al., 2021). Los ULVs de papaya pertenecen a la clase 1, con genomas de 4376 a 4515 nts que incluyen dos ORFs, seguidos de una región larga de ARN no codificante. El ORF1 codifica para una proteína putativa de 31 a 38 kDa, cuya función es desconocida. Por otro lado, el ORF2 codifica una proteína putativa de 45 a 54 kDa que contiene los ocho motivos característicos de las ARN polimerasas dependientes de ARN (RdRp) presente en los virus con genoma de ARNmc (+), filogenéticamente relacionada con la RdRp de los umbravirus (Zamudio-Moreno et al., 2015; Sa Antunes et al., 2016; Cornejo-Franco et al., 2021; Liu et al., 2021). Se han identificado dos señales en el genoma viral, entre el ORF1 y ORF2, asociados con el mecanismo de cambio de marco de lectura para que el ribosoma retroceda un nucleótido (-1 FS). Una región deslizante con la secuencia consenso X XXY YYZ (el heptanucleótido) (Cornejo-Franco et al., 2021) seguida de una estructura secundaria de ARN en forma de horquilla o pseudonudo (Liu et al., 2021). Este mecanismo contribuye al control de la estequiometría de las proteínas bajo su regulación, por lo que es crucial para una infección viral exitosa (Penn et al., 2020). El cambio de marco de lectura del ribosoma es común en miembros de la familia Tombusviridae. Su ocurrencia se demostró experimentalmente para el Virus del mosaico de la enación del chícharo 2 (Pea enation mosaic virus 2 - PEMV2) del género Umbravirus (Gao y Simon, 2016; Liu et al., 2021) y para el Virus asociado al amarillamiento de las venas de los cítricos (Citrus yellow vein associated virus - CYVaV) de los ULVs de clase 2. Para este último se identificó una proteína de 81 kDa, producto del ORF1 y del ORF2, mediante la técnica de transcripción/traducción in vitro (Liu et al.; 2021). Sin embargo, el mecanismo de -1FS aún no se demuestra para los ULVs de papaya.

A la fecha, no ha sido posible detectar las proteínas virales en plantas con meleira de la papaya (Rodrigues et al., 2009) y no se han obtenido anticuerpos para su diagnóstico. La obtención de anticuerpos contra proteínas virales, como la RdRp, resulta valioso para el estudio y monitoreo de enfermedades en plantas. Además, son fundamentales en epidemiología, ya que permiten rastrear la propagación y evolución de patógenos virales en poblaciones vegetales, lo que resulta crucial para el desarrollo de estrategias de manejo eficientes y la predicción de futuros brotes (Rubio et al., 2020; Buja et al., 2021). Asimismo, el desarrollo de anticuerpos permite realizar estudios funcionales de proteínas virales, como las polimerasas, incluyendo su expresión y su interacción con elementos del hospedante, lo que resulta esencial para el desarrollo de estrategias antivirales y la comprensión de las bases moleculares de la replicación viral (Bolanos-García y Davies, 2006; Trier et al., 2019; Rubio et al., 2020). Sin embargo, cabe desatacar que la purificación de las RdRps a partir de células del hospedante resulta difícil debido a sus bajos niveles de expresión (Cevik et al., 2008). Además, estas enzimas suelen estar asociadas con membranas, lo que complica su aislamiento debido a problemas de estabilidad del péptido (Laliberté y Sanfaçon, 2010; Hull, 2014). Una alternativa para superar estas dificultades la constituye la expresión de proteínas recombinantes en E. coli (Cevik et al., 2008). En este sentido, se ha demostrado previamente la viabilidad de esta estrategia para el desarrollo de anticuerpos contra la RdRp del Virus de la tristeza de los cítricos (Citrus tristeza virus - CTV), lo que permitió la detección y localización de la proteína en tejidos de cítricos infectados con CTV (Cevik, 2001; Cevik et al., 2008). De manera similar, las polimerasas del Virus del moteado de las venas de tabaco (Tobacco vein mottling virus - TVMV), Virus del mosaico del bambú (Bamboo mosaic virus - BaMV) y SARS-CoV-2 han sido expresadas en E. coli, obteniéndose anticuerpos que han facilitado avances en la caracterización de sus funciones y actividad catalítica (Hong y Hunt, 1996; Li et al., 1998; Dangerfield et al., 2021; Madru et al., 2021). Este estudio tuvo como objetivo desarrollar un método para la producción y purificación de la proteína recombinante codificada por el ORF2 de PMeV-Mx en E. coli y generar anticuerpos específicos para su detección, un paso clave para avanzar en el diagnóstico y la investigación básica del virus.

Plantas de papaya como reservorio del virus. Las semillas de papaya variedad Maradol se germinaron y las plántulas fueron trasladadas a un invernadero con malla antiáfidos y suelo como sustrato. Las plántulas de tres meses de edad fueron inoculadas con látex de frutos obtenidos de plantas sintomáticas de la enfermedad de la meleira de la papaya. Se confirmó la presencia de PMeV-Mx en seis de estas plantas mediante RT-PCR, de acuerdo con el procedimiento previamente establecido (Zamudio-Moreno et al., 2015).

Análisis de secuencias. Se empleó el programa UGENE para analizar la región codificante del genoma de PMeV-Mx (Número de accesión KF214786 de la base de datos GenBank del NCBI). Se predijeron los marcos de lectura abiertos, así como los productos proteicos de ORF1 y ORF2 de manera independiente y como una proteína de fusión del ORF1/ORF2. Se identificó la secuencia heptamérica, también denominada sitio deslizante, de acuerdo a los parámetros establecidos previamente (Cornejo-Franco et al., 2021).

Construcción de plásmidos. Las regiones correspondientes tanto al ORF1 como al ORF2 de PMeV-Mx se amplificaron por PCR con los cebadores CB157/CB158 y CB183/CB184 (Cuadro 1), respectivamente. Para ello se emplearon 2 μL de ADNc de plantas de papaya infectadas, obtenido como se reportó previamente (Zamudio-Moreno et al., 2015). La reacción de PCR se realizó en un volumen de 25 μL [solución de PCR (1x); 1,5 mM de MgCl2; 0,2 mM de dNTPs; 0,2 μM de cebadores; 2 Unidades de Platinum™ Taq DNA Polimerasa (Invitrogen, Massachusetts, USA)]. El producto de PCR se purificó con el estuche comercial QIAquick PCR Purification (Qiagen, Hilden, Alemania). Posteriormente se ligó en pGEM-T Easy siguiendo las instrucciones del fabricante (Promega, Wisconsin, USA) para producir los plásmidos pCB251 (pGEM-T Easy:ORF1) y pCB233 (pGEM-T Easy:ORF2). La presencia del inserto se corroboró mediante PCR, con cebadores dirigidos a las regiones promotoras SP6 y T7 de pGEM-T Easy (Cuadro 1). El ADN plasmídico se purificó con el estuche comercial QIAprep Spin Miniprep (Qiagen, Hilden, Alemania) y se secuenció en ambas direcciones (Macrogen Inc., Seúl, Corea).

Cuadro 1

Cebador	Secuencia (5’ a 3’)y	Región a la que se unenz
CB135	TAATACGACTCACTATAGGG	Promotor T7 de pGEM-T Easy
CB136	ATTTAGGTGACACTATAGAA	Promotor SP6 de pGEM-T Easy
CB157	ATGAACATTTCGAACATTCCC	Sentido ORF1
CB158	GGATCCTTACGGGCCAACCAGAAAA	Antisentido ORF1
CB183	aattagatatcATGGTTTATACCTTCATCAAA	Sentido ORF2
CB184	taattaagcttCTAAGGGGTTAAGATAAGC	Antisentido ORF2
CB107	aaaaagcaggcttcATGAACATTTCGAACATTCCCGT	Sentido ORF1 y sitio attB1
CB108	agaaagctgggtcTTACGGGCCAACCAGAAAAGGACGA	Antisentido ORF1 y sitio attB2
CB191	aaaaagcaggctccATGGTTTATACCTTCATCAAA	Sentido ORF2 y sitio attB1
CB193	agaaagctgggtcAGGGGTTAAGATAACCCTAGG	Antisentido ORF2 y sitio attB2
CB194	ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggct	Adaptador attB1
CB195	ggggaccactttgtacaagaaagctgggt	Adaptador attB2

yLetras en minúscula indican secuencias no virales, como sitios de restricción y nucleótidos extras (CB183 y CB184), o sitios recombinantes (CB107, CB108, CB191, CB193, CB194 y CB195). Letras en negritas indican codones de inicio y de parada. zORF, marco de lectura abierto; attB, sitio de unión específica para recombinación por tecnología Gateway.

Los amplicones del ORF1 y ORF2 de PMeV-Mx se recombinaron con pDONR221 empleando la tecnología de Gateway (Invitrogen, Massachusetts, USA) para generar pCB247 (pDONR221:ORF1) y pCB249 (pDONR221:ORF2), respectivamente. Posteriormente, estos plásmidos se recombinaron en pDEST17 (Invitrogen, Massachusetts, USA) para generar pCB252 (pDEST17:ORF1) y pCB253 (pDEST17:ORF2). La recombinación mediante la tecnología Gateway se realizó mediante dos reacciones de PCR, el primero con cebadores específicos para los ORF1 y ORF2 de PMeV-Mx, respectivamente que agregaron la mitad de los sitios attB (CB107/CB108 y CB191/CB193), y el segundo, con un par de cebadores que permitieron completar los sitios attB (CB194/CB195) (Cuadro 1). La mezcla de reacción y las dos reacciones de PCR se realizaron de acuerdo al manual de tecnología Gateway (2021) (Invitrogen, Massachusetts, USA). Los productos finales de PCR fueron recombinados con el vector de entrada pDONR221 (Invitrogen, Massachusetts, USA), empleando la mezcla de enzimas BP CLONASE (Invitrogen, Massachusetts, USA), de acuerdo a las instrucciones del fabricante. Los productos de recombinación fueron introducidos en células competentes de E. coli DH5α y seleccionados en placas de agar Luria Broth (LB) suplementadas con 100 mg mL^-1 de kanamicina. Los vectores de entrada resultantes, pCB247 y pCB249, se secuenciaron en ambas direcciones (Macrogen Inc., Seúl, Corea). El ADN plasmídico se extrajo y se utilizó para la recombinación con el vector de destino pDEST17 (Invitrogen, Massachusetts, USA) para generar pCB252 y pCB253, respectivamente, con la mezcla de enzimas LR CLONASE (Invitrogen, Massachusetts, USA), siguiendo las instrucciones del fabricante. Los productos fueron introducidos en células de E. coli DH5α, seleccionados en placas de agar LB suplementadas con 100 μg mL^-1 de ampicilina. El ADN plasmídico se secuenció y se utilizó para transformar la cepa

E. coli BL21.

Expresión y purificación de proteínas recombinantes en E. coli. Se evaluaron las condiciones de temperatura óptimas para la expresión de la RdRp de PMeV-Mx, realizando un seguimiento temporal de su expresión. Para ello se utilizaron células de E. coli BL21 portadoras de pCB253 que se inocularon en 5 mL de medio LB con 100 μg mL^-1 de ampicilina e incubaron a 37 °C y 200 rpm, durante 14 horas. De este preinóculo, se transfirieron 500 μL a 300 mL de medio LB bajo las mismas condiciones, hasta alcanzar una densidad óptica a 600 nm de 0,6. Posteriormente, se retiraron 40 mL de medio y se almacenaron como control no inducido. Se añadió IPTG 1 mM al resto del inóculo y se incubó durante 6 h a 37 °C y 200 rpm. Cada hora, se retiraron 40 mL de cultivo. Ambos cultivos, inducidos y no inducidos, se centrifugaron a 5000 rpm durante 10 minutos, el precipitado se resuspendió en 2 mL de solución de extracción de proteínas bajo condiciones desnaturalizantes (100 mM de NaH2PO4; 10 mM de Tris-Cl; 8 M de Urea, pH 8,0), como se describe en el Manual QIAexpressionist, 2003 (QIAGEN, 2003). La suspensión se mantuvo en hielo y se sonicó empleando ciclos de 20 segundos hasta que perdió la viscosidad. Posteriormente, se trató con 0,2 mM de fenilmetilsulfonilfluoruro (PMSF) y se centrifugó a 12000 rpm y 4 °C durante 10 minutos. El sobrenadante se almacenó a -80 °C y el precipitado se resuspendió en 3 mL de solución de extracción de proteínas.

Para el ensayo de inmunodetección de proteínas recombinantes, los extractos proteicos de E. coli se incubaron durante 3 h a 92 °C, se separaron en un gel de poliacrilamida al 12 % con dodecil sulfato de sodio (SDS) y se transfirieron a una membrana de fluoruro de polivinilideno (PVDF), aplicando 100 voltios durante 1 h. Las membranas se bloquearon mediante incubación con 0,1 % PBS-T/5 % de leche (w/v) durante 1 h a temperatura ambiente, seguidas de tres lavados de 20 minutos cada uno con 0,1 % PBS-

T. Posteriormente, se incubaron durante 12 h a 4 °C, con una dilución 1:1000 del anticuerpo monoclonal Anti-His acoplado a peroxidasa de rábano (HRP) (Invitrogen #R931, Massachusetts, USA). Después, se realizaron dos lavados con 0,1 % PBS-T. Tras la incubación con el sustrato (ECL, Thermo Fisher Scientific, Pierce, Massachusetts, USA), se registraron las imágenes en el sistema de documentación Gel Doc XR+ (Bio- Rad Laboratories, Inc., California, USA). Para este ensayo, se utilizó como control positivo la proteína 6xHis-GST-8xHis, expresada a partir de pET42b (Novagen, Merck KGaA, Darmstadt, Alemania).

Para purificar las proteínas recombinantes se partió de cultivos de E. coli BL21 con los plásmidos en 500 mL de medio LB a las 2 h después de la inducción. La purificación se llevó a cabo según lo descrito previamente y siguiendo las instrucciones del Manual QIAexpressionist (Qiagen, 2003), con la excepción de la cantidad de solución de extracción utilizada (6 mL). Las proteínas recombinantes se purificaron por afinidad en una columna empaquetada con resina de nitrilotriacetato de níquel (Ni-NTA) (Qiagen) y se lavaron tres veces con solución de lavado a pH 6,3. Para las eluciones se emplearon soluciones de elución con pH 5,9 y 4,5, respectivamente.

Producción de antisuero. Las proteínas recombinantes purificadas se separaron en geles de poliacrilamida al 12 % con SDS. La banda correspondiente a la proteína recombinante 6xHis-pORF2 se cortó del gel y se liofilizó. Posteriormente, la proteína liofilizada se mezcló con 200 µL de PBS, se cuantificó en un espectrofotómetro NanoDrop 2000 (Thermo Fisher Scientific, Massachusetts, USA). Para la primera inoculación, esta solución se mezcló con 200 µL de adyuvante completo, y para las siguientes, con adyuvante incompleto (Amero et al., 1988). Posteriormente, las emulsiones se inocularon por vía subcutánea en uno o dos puntos del dorso de dos conejos. Antes de la inmunización, se extrajeron 500 µL de sangre para verificar la ausencia de reactividad al antígeno en el suero preinmune. La primera inmunización se realizó con 100 μg de proteína, y se repitió dos semanas después (500 μg de proteína), seguida de una primera recolección de 3 mL de sangre diez días después. Posteriormente, los conejos descansaron durante cuatro semanas, tras lo cual se administró una inmunización final (100 μg de proteína), seguida de una recolección de 5 mL de sangre siete días después empleando un catéter neonatal. La sangre se centrifugó a 3000 rpm durante 20 minutos a 4 °C y los antisueros se almacenaron a -20 °C (Amero et al., 1988; Pihl et al., 2015).

Se realizó un dot blot para verificar la reactividad del suero e identificar la dilución óptima de trabajo. Para ello se evaluaron las siguientes diluciones: 1:500, 1:1000, 1:2000, 1:3000 y 1:4000. El ensayo se llevó a cabo de la siguiente manera: se añadieron 10 μL de antisuero a una membrana de nitrocelulosa (1 cm²), que luego se bloqueó con una solución de 5 % de leche en polvo descremada en PBS-T 1X durante 1 h, con agitación a temperatura ambiente. Posteriormente, la membrana se incubó toda la noche, a 4 °C con las diferentes diluciones del anticuerpo primario. Luego, se realizaron tres lavados con PBS-T, seguidos de una incubación con el anticuerpo secundario anti-conejo acoplado a HRP (dilución 1:3000) durante 2 h, a temperatura ambiente.

Para confirmar la especificidad de los antisueros y anticuerpos, se realizaron ensayos de inmunodetección. En este caso, la detección se llevó a cabo con una dilución 1:1000 de anti-pORF2 como anticuerpo primario y una dilución 1:3000 del anticuerpo secundario anti-conejo acoplado a HRP (PROMEGA #W401B), con membrana de nitrocelulosa. Para este ensayo, se emplearon dos proteínas fusionadas a etiquetas de histidina (His) como controles negativos: 6xHis-GST-8xHis, expresada a partir del plásmido pET42b (Novagen, Merck KGaA, Darmstadt, Alemania), y 6xHis-pORF1, codificada por el ORF1 de PMeV-Mx y expresada a partir de pCB252 (Invitrogen, Massachusetts, USA).

Predicción de las proteínas putativas de PMeV-Mx. El genoma parcial de PMeV-Mx contiene dos ORFs, el primero se ubica desde el nucleótido 1 hasta el 963 (ORF1) y el segundo desde el nt 1231 hasta el 2437 (ORF2). Estos marcos de lectura codifican dos proteínas putativas de 35 y 45,6 kDa, respectivamente, denominadas pORF1 y pORF2 (Figura 2). Se detectó, igualmente, un sitio de desplazamiento (heptanucleótido) en la posición 942-948 (UCCUUUU), que constituye una señal putativa para el -1 FS (Figura 2). Este elemento en cis podría participar para generar una proteína de fusión entre el ORF1 y el ORF2, como se ha propuesto para BabVQ (Cornejo-Franco et al., 2021). Sin embargo, el análisis de secuencia del genoma de PMeV-Mx en el presente estudio no respalda dicha premisa, en virtud de que existen codones de paro, generando en su lugar una proteína putativa truncada.

Figura 2.Organización

Expresión y purificación de la proteína de fusión recombinante 6xHis-pORF2. Se realizó un ensayo de curso temporal para determinar las mejores condiciones para la expresión de la proteína recombinante 6xHis-ORF2. En este sentido, se observó a partir de 1 h después de la inducción con IPTG una proteína muy abundante que migraba entre los marcadores de 37 y 50 kDa, contrario a lo observado en el tratamiento sin inducir (Figura 3). Estos resultados son consistentes con la masa estimada (~46,5 kDa) para la proteína codificada por el ORF2 de PMeV-Mx y la etiqueta His. Cabe destacar también que se observa un aumento notable en la expresión a partir de las 2 h y hasta las 6 h después de la inducción (Figura 3).

Figura 3

Considerando los datos obtenidos en el ensayo de expresión temporal, se seleccionó un período de inducción de 2 h para maximizar el rendimiento de la expresión proteica. Para corroborar estos resultados, la proteína recombinante de PMeV-Mx 6xHis-pORF2 se detectó por western blot con el anticuerpo anti-His acoplado a HRP. Como se esperaba, se observaron bandas de ~46,5 y ~28 kDa (Figura 4B, carriles 3 y 4), correspondientes a las proteínas 6xHis-ORF2 y 6xHis-GST-8xHis, respectivamente. Este resultado confirma la presencia de la etiqueta de His en la proteína recombinante 6xHis-pORF2 y la integridad de la misma (Figura 4). Los resultados obtenidos a partir de la purificación con resina Ni-NTA se muestran en la Figura 5. En este sentido, se observó una banda intensa del tamaño esperado, ~46,5 kDa, en cada elución. Igualmente, se observaron bandas tenues que van desde 15 hasta 150 kDa, tanto en la elución como en la resina Ni-NTA. Manteniendo las condiciones previamente establecidas, se realizaron ocho purificaciones de fracciones celulares de 20 mL. Como resultado, se obtuvieron 800 µg de la proteína 6xHis-pORF2 purificada que se usaron posteriormente para la producción de anticuerpos.

Figura 4

Figura 5

Especificidad de los anticuerpos policlonales anti-pORF2. Se empleó suero preinmune para corroborar la ausencia de reactividad contra la proteína recombinante 6xHis-pORF2 de PMeV-Mx. Posteriormente, se determinó el título del suero después de la inmunización, detectándose señal en el rango de diluciones de 1:500 a 1:3000. Se seleccionó la dilución 1:1000 para los siguientes análisis. Una vez establecido este parámetro, la especificidad de los anticuerpos anti-pORF2 se evaluó mediante inmunoensayos (Figura 6). Como resultado, se detectó una señal de ~46,5 kDa en las fracciones celulares correspondientes a 6xHis-pORF2, confirmando la presencia de la proteína de interés en las fracciones purificadas y demostrando la capacidad de los anticuerpos para reconocerla específicamente. La ausencia de señal en los controles negativos, correspondientes a la altura de ~28 kDa para 6xHis-GST-8xHis y de ~35 kDa para 6xHis-pORF1 de PMeV-Mx, reafirmó la especificidad de los anticuerpos. Estos controles negativos se incluyeron para descartar interacciones inespecíficas ya sea con otras proteínas presentes en las fracciones celulares o con la etiqueta de His. Sin embargo, se observó que el anticuerpo también presentó reactividad inespecífica con proteínas de

E. coli, ya que se detectó una señal a la altura de ~75 kDa en las fracciones celulares no inducidas y en las inducidas para 6xHis-pORF1, 6xHis-GST-8xHis y 6xHis-pORF2 (Figura 6, B).

Figura 6

En este estudio se describe por primera vez la expresión en E. coli de la proteína recombinante codificada por el ORF2 de PMeV-Mx, su purificación y la generación de anticuerpos policlonales de conejo. E. coli es un sistema de expresión ampliamente utilizado para proteínas recombinantes, conocido por su alto rendimiento y procesos de purificación simplificados (Jia y Jeon, 2016). El uso de este enfoque, al permitir la obtención de grandes cantidades de proteína, resulta útil para estudios bioquímicos y biofísicos. En contraste, la extracción de proteínas directamente desde tejidos vegetales puede ser un desafío debido a los bajos niveles de expresión de la RdRp y la presencia de proteínas contaminantes. Además, en comparación con los sistemas in vitro libres de células, la expresión en E. coli ofrece ventajas como costos reducidos, mayor simplicidad y la posibilidad de modificaciones postraduccionales y ensamblaje de proteínas (Rosano y Ceccarelli, 2014; Jia y Jeon, 2016).

Durante este estudio, la proteína recombinante 6xHis-pORF2 de PMeV-Mx (~46,5 kDa) se detectó en los extractos proteicos insolubles de E. coli a partir de la primera hora de inducción y hasta las 6 h posteriores. Su acumulación en la fracción insoluble era esperada, ya que las ARN polimerasas virales suelen estar asociadas a membranas (Laliberté y Sanfaçon, 2010; Hull, 2014). Aunque la mayor expresión se observó a las 5 h post-inducción (Figura 3), se seleccionó un tiempo de 2 h para la purificación con el fin de minimizar la formación de cuerpos de inclusión, un fenómeno común cuando se presentan altos niveles de expresión de proteínas, así como de proteínas asociadas a membranas (Qiagen, 2003). La identidad de la proteína recombinante se confirmó mediante western blot con anticuerpos anti-His (Figura 4), y su purificación fue exitosa (Figura 5), permitiendo su uso en la generación de anticuerpos policlonales en conejo.

Los anticuerpos obtenidos detectaron específicamente la proteína recombinante 6xHis-pORF2 de PMeV-Mx en extractos de E. coli, sin reconocer las proteínas 6xHis- pORF1 de PMeV-Mx ni 8xHis-GST-6x, lo que demuestra su especificidad (Figura 6). Sin embargo, también se observó una banda de ~75 kDa en todos los extractos proteicos, lo que sugiere la posible unión inespecífica de proteínas bacterianas a la resina Ni-NTA durante la purificación, como se ha informado previamente (Ryan y Henehan, 2013). Para reducir esta interferencia, sería recomendable optimizar las condiciones de la resina ajustando factores como la concentración de sal, pH e imidazol, además de evaluar diferentes tipos de resinas con mayor selectividad (Wang et al., 2020). Asimismo, la inclusión de un paso adicional de cromatografía, como exclusión por tamaño o intercambio iónico, podría mejorar la pureza de la proteína de interés (Saraswat et al., 2013; Soltaninasab et al., 2022). Por otro lado, el uso de un paso extra de cromatografía de afinidad podría incrementar la especificidad y sensibilidad de los anticuerpos, lo que facilitaría su aplicación en el diagnóstico de plantas infectadas (Saraswat et al., 2013).

El uso de anticuerpos constituye una herramienta esencial en estudios básicos, particularmente en la detección y caracterización de proteínas virales. En el caso de PMeV-Mx y los ULVs de papaya de clase 1, la proteína codificada por el ORF2 presenta los ocho motivos característicos de las ARN polimerasas dependientes de ARN; sin embargo, su expresión y función en plantas aún no han sido caracterizadas. En contraste, la replicación de otros virus pertenecientes al género Tombusvirus (familia Tombusviridae) ha sido ampliamente estudiada. Por ejemplo, la RdRp del Virus del enanismo ramificado del tomate (Tomato bushy stunt virus - TBSV), de 92 kDa, se produce mediante una lectura continua del codón de paro del ORF1 (readthrough) continuando la traducción del ORF2 (Salonen et al., 2005; Rubino y Scheets, 2021). Mientras que la replicasa se forma de la interacción entre la proteína auxiliar de replicación p33 (producto de ORF1) y p92 (Salonen et al., 2005; den Boon et al., 2010). Se ha propuesto que en los ULVs de clase 1, de papaya, se podría producir una proteína de aproximadamente 90 kDa, correspondiente a la RdRp, mediante -1FS, similar a lo demostrado in vitro para los ULVs de clase 2 y los umbravirus (Liu et al., 2021). No obstante, esta hipótesis aún no ha sido confirmada en plantas y se requiere hacer más estudios. En este contexto, el uso de anticuerpos podría ser clave para detectar proteínas virales y profundizar en la expresión y función de la RdRp.

En este estudio, se estableció un protocolo para la expresión, detección y purificación de la proteína recombinante 6xHis-pORF2 de PMeV-Mx en E. coli, su RdRp putativa. Los anticuerpos en conejo detectaron la proteína de interés en fracciones celulares de E. coli; sin embargo, aún es necesaria la optimización del protocolo para mejorar su especificidad en extractos celulares de bacterianos.